Ученый / Постдок по молекулярным исследованиям экологии микроорганизмов в экосистемах марганцевых конкреций глубоководных районов моря (ф/м/д)

Центр полярных и морских исследований Института Альфреда Вегенера (Alfred Wegener Institute Helmholtz Centre for Polar and Marine Research) - это научно-исследовательский центр, поддерживаемый Федеративной Республикой Германия, свободным ганзейским городом Бремен и землями Бранденбург, Шлезвиг-Гольштейн и Нижняя Саксония, в котором работают около 1400 сотрудников. В широком междисциплинарном подходе мы проводим полярные и морские исследования и в сочетании с многочисленными университетскими и неуниверситетскими исследовательскими институтами вносим важный вклад в глобальные исследования окружающей среды, земной системы и палеоклимата. Ученый: in / Postdoc для молекулярных исследований микробной экологии в глубоководных клубнях марганца (w/m/d) Предыстория В то время как некоторые компании уже работают над ранним началом глубоководной добычи полезных ископаемых, все еще существует необходимость в срочных исследованиях воздействия на окружающую среду. В рамках проекта JPI-Oceans MiningImpact группа компаний Deep Sea Ecology and Technology Group проводит работы по изучению влияния деградации полиметаллических (или «манганских») клубней на бентические сообщества глубоководных обитателей и их функции. Исследование сосредоточено на промышленных испытаниях, проведенных прототипом сборщика марганцевых клубней Patania II, которые были проведены в зоне Кларион-Клиппертон-Фрахтюр (CCZ) в субтропической восточной части Тихого океана в 2021 году. Непрерывные условия и их пространственно-временная изменчивость (базовые линии) сравниваются с исследованиями после воздействия, охватывающими период от нескольких дней до нескольких лет после имитации деградации марганцевой трубки. На третьем этапе проекта основное внимание будет уделено бактериям и археологическим сообществам на дне моря. Уникальный набор данных с последовательностями ДНК/РНК (метабаркоды, метагеномы и метатранскриптомы из отложений, почвенных вод и клубней марганца) в сочетании с данными о скорости метаболизма и биогеохимии осадка станет основой работы. В рамках проекта будут проведены дальнейшие отбор проб и измерения в ЗКК для изучения последствий испытания коллектора в более длительных временных масштабах. Помимо научной публикации вносятся вклады в подготовку результатов проекта по научно обоснованному регулированию возможной глубоководной добычи полезных ископаемых в будущем.

Работа будет сосредоточена на бентических микробных сообществах в экосистемах марганцевых труб CCZ, сочетая анализ таксономического и функционального разнообразия и сочетая их со знанием условий окружающей среды. В дополнение к бентическим сообществам, микроорганизмы исследуются в почвенных водах, клубнях марганца и искусственных клубнях из экспериментов по колонизации, чтобы полностью определить воздействие на окружающую среду и оценить возможные меры по перенасыщению. Работа включает совместный анализ в рамках AWI и сети партнеров проекта (например, по различным факторам окружающей среды и сообществам других классов размеров). Основные задачи включают: проведение биоинформатического анализа молекулярных данных микроорганизмов (метабаркодирование, метагеномы, метатранскриптом) и оценка результатов в отношении таксономического и функционального разнообразия микробных сообществ (например, состав и структура сообществ, кодированные и экспрессированные метаболические пути) Оценка информации, полученной из молекулярных данных, и сочетание с существующими данными об условиях окружающей среды с использованием подходящих статистических методов Характеристика воздействия туберкулеза на окружающую среду и исследование потенциальных показателей (например, специфических микробных таксонов и функций) для ухудшения состояния экосистем и, возможно, последующего восстановления Публикация и презентация результатов в научных журналах и на конференциях Вклад в комплексный междисциплинарный анализ в проектном консорциуме и совместные публикации и доклады Участие в экспедиции (экспедициях) и проведение микробного отбора проб, лабораторных инкубаций, экстракций и анализов на борту, а также в лаборатории института Участие в общих проектных задачах (например, ежегодные совещания, участие и организация семинаров, отчетность, управление данными)

Продвижение в морской микробной экологии с акцентом на молекулярную экологию или экологическую геномику или тесно связанные темы - в идеале с акцентом на глубоководные Профессиональный опыт работы в качестве постдока (не менее 2 лет) и доказанный опыт научной публикации Полное знание биоинформатического анализа таксономического и функционального биоразнообразия и кодированных/экспрессированных метаболических путей морских микробных сообществ (на основе метабаркодирования, метагеномов и метатранскриптомов) Знание биоинформатических инструментов и трубопроводов для предварительной обработки данных, создание таблиц Amplicon Sequence Variant (ASV), реконструкция генов/номистов, прогнозирование филогенетического происхождения последовательностей и генов ДНК, классификация молекулярных особенностей и кластеризация белков на основе структуры и функции Знание R, Python, Unix/Linux-Command-Line Инструменты и автоматизация рабочих процессов Обширные знания соответствующих метрик и методов анализа естественных микробных сообществ и функций и их пространственно-временных паттернов (например, альфа/бета-разнообразие, дифференциальное изобилие и экспрессия генов, физиогенетика, сравнительная пангеномика и реконструкция метаболических путей) Полное знание соответствующих молекулярных баз данных для таксономических и функциональных аннотаций Знание молекулярной лабораторной работы, включая извлечение ДНК / РНК, ПЦР и создание библиотек для NGS Возможность работать самостоятельно и в сотрудничестве с партнерами по проекту. Планирование научно-исследовательской деятельности, включая совместное использование и анализ результатов Готовность участвовать в экспедициях и международных поездках на проектных совещаниях и конференциях Проникнутые коммуникативные и командные навыки Отличное знание английского языка в слове и письме (согласно уровню C1) Необходимые навыки, знания и опыт Знание микробных метаболических процессов и методов их исследования (например, инкубаций на основе индикаторов) и общей морской/бентической биогеохимии Интерес и готовность приобретать и применять методы машинного обучения для экологического анализа Опыт экспедиции

Отличное исследование Сотрудничество и сотрудничество - внутренние институты, национальные и международные, междисциплинарные Возможности для развития - в вашем собственном месте и в других местах Международная среда – повседневные контакты с людьми со всего мира гибкое рабочее время Продвижение здоровья компании и корпоративный фитнес с Hansefit и Wellhub Предложения поддержки и живая культура примирения работы и семьи профессиональное пенсионное обеспечение (VBL) JOBV1_EN