Старший специалист по операциям по доставке вычислительной патологии (п/п/д)

• ОПИСАНИЕ СИТА -
• Мюнхен,
• Германия

В Computational Pathology Munich (CPM) мы вносим значительный вклад в высокопроизводительные исследования и разработки, основанные на данных. Наша команда работает в сложной, быстро меняющейся среде, где отличное сотрудничество, четкое общение и точная организация имеют решающее значение.

• Мы ищем старшего специалиста по операциям по доставке вычислительной патологии (m/f/d) в
• Мюнхене для поддержки выполнения рабочих процессов по вычислительной траектории в программах разработки моделей AI/ML и обнаружения биомаркеров.

• Эта роль отвечает за обеспечение надежного выполнения вычислительных процессов патологии, данных, включая прием внутрь, лечение, контроль качества и анализ деятельности. Эта позиция играет ключевую роль в обеспечении того, чтобы данные визуализации, метаданные, аннотации и результаты анализа соответствовали целям разработки ИИ, принятия научных решений и потенциальных нормативных приложений.

• Эта роль находится на пересечении патологии, науки о данных и инженерии искусственного интеллекта и тесно сотрудничает с внутренними командами и внешними партнерами для управления сложными наборами данных и поддержания высоких стандартов качества данных, соответствия и выполнения рабочих процессов.

• Идеальный кандидат - высокоорганизованный и надежный специалист по данным с опытом управления или биомедицинскими наборами данных, сильным вниманием к деталям и способностью эффективно координировать различные заинтересованные стороны в динамичной исследовательской среде.

• Ключевые обязанности

• Передача данных и курирование
• Координировать работу с влажными лабораториями, контрактными исследовательскими организациями (CRO) и внешними сотрудниками для облегчения передачи данных визуализации и связанных с ними метаданных. Обеспечить доставку входящих наборов данных в соответствии с определенными форматами данных, стандартами метаданных и требованиями проекта. Управляйте и интегрируйте наборы данных из нескольких источников, включая цифровые изображения патологии, метаданные выборки, клинические информационные испытания, реальные данные и результаты анализа изображений. Перевести требования к научному и модельному развитию в задачи подготовки структурированных наборов данных. Проверять полноту, точность и качество наборов данных в соответствии с внутренними стандартными операционными процедурами. Убедитесь, что данные визуализации, аннотации и метаданные подходят для разработки, проверки и научного анализа моделей ИИ / мл. Поддерживать согласованность, прослеживаемость и удобство использования наборов данных в рабочих процессах вычислительной патологии.

• Исполнение рабочего процесса для вычислительной патологии
• Выполнять вычислительные патологические рабочие процессы в проектах разработки моделей ИИ и открытия биомаркеров. Выполняйте задачи по подготовке оперативных данных, включая объединение, поднастройку и разделение, а также консолидацию аннотаций. Запустите конвейеры анализа изображений для создания количественных считываний, поддерживающих открытие биомаркеров и принятие программных решений. Загружать и управлять результатами анализа в облачных платформах данных (например, QuartzBio).

• Управление данными, соблюдение и документация
• Обеспечить соответствие наборов данных внутренней политике поиска в качестве глобального стандарта для биологических образцов человека и других соответствующих структур управления. Инициировать и координировать процессы утверждения данных (например, утверждения iDAP) с командами Data Office и Data Provisioning Operations, когда это необходимо. Обеспечение подготовки наборов данных в соответствии с согласованными принципами и предотвращение непреднамеренного изменения наборов данных. Автор планов и отчетов по анализу вычислительной патологии, включая планы сбора данных для разработки моделей.

• Кроссфункциональный
• Сотрудничество
• Работайте в тесном сотрудничестве с менеджерами программ, руководителями биомаркеров вычислительной патологии, патологами, инженерами машинного обучения и специалистами по данным, чтобы обеспечить эффективное использование ресурсов данных. Четко сообщать о готовности данных, ограничениях и неопределенности для поддержки и принятия научных решений.

• Оперативное совершенство и постоянное совершенствование
• Определите возможности для улучшения рабочих процессов данных, инструментов и операционных процессов в рамках вычислительной патологии. Будьте в курсе новых практик управления данными, цифровых технологий патологии и стандартов данных ИИ.

• Желаемые профили

• Образование
• Степень бакалавра или магистра в области науки о данных, биоинформатики, биомедицинской информатики, биомедицинской инженерии или смежной области. Опыт управления данными в области здравоохранения, диагностики или наук о жизни очень желателен.

• Опыт
• Свободное владение принципами FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) и их применение в управлении данными в области наук о жизни. Опыт работы с крупномасштабными наборами данных изображений (например, цельноскольцевыми изображениями) и связанными с ними метаданными в распределенных или облачных средах. Демонстрированный опыт передачи и обработки мультиисточников и мультимодальных биомедицинских наборов данных, включая данные визуализации, клинические данные, метаданные пациента или образца и результаты анализа. Опыт работы с курированием и интеграцией данных, решение проблем взаимодействия между системами, включая передачу данных, совместимость форматов и гармонизацию метаданных, а также согласование результатов анализа. Сильные рабочие знания облачных сред данных, современных платформ данных и рабочих процессов управления наборами данных. Опыт работы с аннотационными платформами, цифровыми конвейерами патологии или средами для анализа изображений в целом. Понимание требований к данным AI/ML для разработки моделей, проверки и последующего анализа. Опыт работы с версиями наборов данных, воспроизводимыми рабочими процессами подготовки данных и процессами контроля качества. Знание Python или аналогичных языков сценариев для поддержки подготовки данных, автоматизации и контроля качества рабочих процессов.

• Желательно:
• Знакомство с рабочими процессами анализа IHC и цифровым сканированием слайдов. Осведомленность о цифровых стандартах и форматах патологии (например, DICOM, OME-TIFF). Знакомство с управлением данными, процессами соответствия и контролируемой обработкой защищенных наборов данных в регулируемых биомедицинских средах. Рабочие знания атласских инструментов (JIRA, Confluence).

• Ключевые компетенции
• Отличные навыки межличностного, вербального и письменного общения, умение работать вместе в международной матричной среде. Сильное мышление исполнения, с владением и ответственностью за предоставление высококачественных рабочих процессов данных. Высоко структурированный и ориентированный на детали, с сильным контролем. Умение сбалансировать техническую экспертизу с прагматичными решениями. Сильные организационные навыки, с возможностью управлять несколькими наборами данных и рабочими процессами одновременно. Сильные навыки решения проблем и ориентированное на решение мышление, особенно при диагностике и решении проблем качества данных или рабочих процессов.

• Чего вы можете ожидать:
• Индивидуальные возможности развития с акцентом на обучение на протяжении всей жизни
• Доверяйте, принимайте и оставляйте место для формирования вещей в сфокусированной и страстной команде. Современные офисные помещения в
• Мюнхене обеспечивают совместную, гибкую и гибкую работу
• Разнообразная, интегрированная и свободная от предубеждений рабочая среда, привлекающая приложения из всех квалифицированных, предупреждающих или характеристик